Championnat d'Allemagne de football de troisième division 1998-1999

La Regionalliga 1998-1999 est la 5e édition de la Regionalliga en qualité de troisième division allemande de football, et sous son format à 4 groupes.

Le championnat oppose soixante-et-onze clubs allemands répartis en trois groupes de dix-huit équipes (Regionalligen Nord, Nord-Est, et Sud) et un groupe de dix-sept équipes (Regionalliga Ouest/Sud-Ouest).

Les premières places des groupes Ouest/Sud-Ouest et Sud permettent de monter directement en 2. Bundesliga lors de la saison suivante. Les champions des groupes Nord et Nord-Est s'affrontent lors d'une rencontre aller-retour afin d'obtenir la troisième place de promotion en 2. Bundesliga. La quatrième place en 2e division est décernée lors d'une phase de promotion opposant le champion défait lors de la rencontre précédente aux équipes vice-championnes des groupes Ouest/Sud-Ouest et Sud.

Les trois dernières places des groupes Nord et Nord-Est, les quatre dernières places du groupe Ouest/Sud-Ouest, et les deux dernières places du groupe Sud sont synonymes de relégation en Oberliga.