Championnat de Malte de football 1999-2000

La saison 1999-2000 de Premier League Maltaise était la quatre-vingt-cinquième édition de la première division maltaise.

Lors de cette saison, le La Vallette FC a tenté de conserver son titre de champion face aux neuf meilleurs clubs maltais lors d'une série de matchs se déroulant sur toute l'année.

Lors de cette saison, le format de la compétition a été changé, les dix clubs participants à la première phase de championnat ont été confrontés à deux reprises aux neuf autres. En gardant une partie des points acquis lors de la première phase, les six premiers se sont ensuite affronté deux fois de plus pour se disputer la victoire finale et les quatre derniers pour éviter la relégation.

C'est le Birkirkara FC qui a été sacré champion de Malte pour la première fois de son histoire.

Trois places étaient qualificatives pour les compétitions européennes, la quatrième place étant celle du vainqueur du Trophée Rothman 1999-2000.